الوصف
وصف
التهجين الفلوري في الموقع (FISH) هو تقنية مستخدمة على نطاق واسع في البحوث البيولوجية. تُظهر صور FISH مواقع أنواع معينة من النوكليوتيدات في الخلية ، مثل نسخ الحمض النووي الريبي الخلوي ، والمناطق الجينية ذات الأهمية مثل الجينات المحددة أو المناطق غير المشفرة ، والميزات الصبغية مثل التيلوميرات وغيرها. على الرغم من أن العد اليدوي للبقع لا يزال أكثر الطرق شيوعًا لمعالجة صور FISH بواسطة الباحثين البيولوجيين ، فإن ظهور تقنيات وضع العلامات عالية الإنتاجية يجعل هذا الأمر صعبًا للغاية ، حيث قد تحتوي صور FISH ذات الإنتاجية العالية لجزيء واحد على آلاف البقع الفردية لكل خلية. توجد استراتيجيات لتحليل بيانات FISH تلقائيًا ، لكن القليل منها قابل للتطبيق على نطاق واسع.
قمنا بتنفيذ وتحليل أداء 4 خوارزميات لعد بقعة FISH ، بالإضافة إلى 3 طرق للمجموعات واستراتيجية تجزئة إضافية بعد المعالجة لتحسين اكتشاف بقعة FISH. لقد وجدنا أن التقسيم المستند إلى K-mean كان يعمل بشكل أفضل عند قياسه بواسطة مؤامرات Precision Recall. وجدنا أن إضافة خطوة أخرى لتجزئة الكشف عن البقع بعد تحسين أداء الخوارزمية الأصلية ، ولكن يلزم إجراء مزيد من التحسين. أخيرًا ، قمنا بتقييم خوارزمياتنا نوعيًا على مجموعة بيانات خلية مشيمة جديدة للماوس ووجدنا نتائج ذات مغزى بيولوجيًا.
كود اردوينو للكشف عن إجهاد العضلات ونمو العضلات
المراجعات
لا توجد مراجعات بعد.